伊達です。

昼休みにやっておきます。こんな感じでどうでしょう。

$ cat add_todo.rb
#!/usr/bin/ruby
start_entry = false
ARGF.each do |line|
  case line
  when /^---/
    start_entry = true
  when /^#\@todo/
    next
  when /^#\@since/
    # nothing
  else
    puts '#@todo' if start_entry
    start_entry = false
  end
  puts line
end
$ find refm/api/src/ -type f -not -path \*.svn\* -exec ruby -i.bak
add_todo.rb {} \;

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ML: ruby-reference-manual@m...
使い方: http://QuickML.com/